代善覆灭的消息传到沈阳，毛钰立即下令再次整编军队。其中活捉代善的郑云峰被提拔为第7军军长，下辖一个骑兵师和两个步兵师，负责松花江南岸和开垦和流云岛的清剿工作。并且成立松江省，孔敏型为首任行政长官，毛钰这要要充分发挥他在农业当面的才华，流云岛同时在行政区划上划归松江省。
同时成立白山省，实行军管理，叶流云为第6军军长和首任行政长官，管一个骑兵师和两个步兵师。负责牡丹江以南开源以北也和拉拉部以东大海以西的广大山区、草原和平原。而继续围剿黄台的任务则交给了尚可义第2军和毛承作第8军。尚可义为方面军司令，下辖两个骑兵师和三个步兵师一个翼骑兵师。同时成立龙江省，管辖松花江北岸到兴安岭、黑龙江一带的广袤区域。
孔有德第1军和文灵的第4军则继续驻守沈阳，孔有德为方面军司令，下有两个骑兵师四个步兵师，管辖辽河沿岸，以及辽东、辽南等去区域，成立辽宁省。原来的东江所辖区域全部归于辽宁，军队基地等也全部归于孔有德的方面军。
毛承禄的第3军将回到江南和毛承福的地5军一起驻守江南。
这当中除了尚可义和毛承作的两个军是从其他队伍中抽调精锐组成完整编制外，毛承福因为留在江南，军队没有变化，其他人都需要就地招募辽东人或者河南流民继续扩编和训练。等全部完成之后陆军方面就是八个军万人！而留在辽东的有13.5万，这当然不是最终的编制，剩下的步兵就要从浙江和福建百姓中招募，将领也有一份需要从海军中抽调，这也是为了平衡军队兵源和将领的组成。按照毛钰的计划，至少江南四个区域每个区域一个军的编制是不能少的！毛钰同时也给了尚可义和孔有德两个方面军司令继续招募骑兵的权利。目前留个轻骑兵师因为战马充裕可以很快完成重编，接下来要再打造一个一起病史和两个轻骑兵师，只有在骑兵方面压过林丹汗和祖大寿的联军，这两位才有可能乖乖听话！
马光率领的警卫团也要扩编成混成师，负责毛钰的警卫和杭州的手别。而毛赟在金涛的独立团也扩编为混成师负责杭州、舟山等地军工企业的警卫。同时台湾岛的毛永杰和毛友俊也已经提拔为说好将负责在台湾岛的训练基地日常操练和台湾岛的驻守。等到这一系列扩编完成之后江南也将拥有4个军左右的步兵！
本来毛钰想想请卢象升留在沈阳总督东北的，但卢象升不愿意公开身份，只能做罢。而毛钰如今的诶手下文官虽然不缺，但能够作为总督的人还真没有。倒是被崇祯免职的洪承畴有这个能力，但是因为毛钰集团的军队是军衔制，加上操典和武器完全不同，毛钰已经将这支军队超前了这个时代许多年。接下来毛钰也不需要看朱由检和天下人的脸色了，他在等待李自成和张献忠等人的再次崛起，不是毛钰故意反攻在那个，而是这些年大明的天灾人祸实在太多了，毛钰就算拿出全部家底也养活不了那么多的灾民！
京城的崇祯听闻代善被灭，黄台吉被林丹汗追击，同时被毛钰锁在草原上不得归，心中感叹，早知道就留在宁远城坐收渔利了。不过他也明白，如果没有祖大寿和虎大威的叛离的，他在关宁锦还有七个残破的总兵，加起来把酒万人还是有的，加上毛钰虽然没有回复接受吴王的册封但也没有公开造反，那么朝廷在辽东甚至奴儿干都司重新驻兵也是顺理成章的。但是现在祖大寿所在的祖家盘踞锦州隔断了大明朝廷和东北的来往！而且祖大寿不是毛钰，他世居辽西，拥兵自重，扯旗造反只是分分钟的事情，崇祯只能寄希望于祖大寿保持独立，如此一来至少山海关不需要直接面对毛钰驻扎在辽东的大军。
所以当毛钰意气风发地在沈阳城接见江南乡绅的时候，朱由检却阴沉着脸终日不知所谓。不是他不想处置毛钰，如今毛钰已经尾大不掉了，而林丹汗似乎也听毛钰的。大明朝廷内部却还有无数的农民军在蠢蠢欲动。杨嗣昌也劝说过他，毛钰如今已经长成，只能徐徐图之。
只是大明朝廷如今的模样哪里还有机会徐徐图之，毛钰的海军肆无忌惮地从河南、南直隶江北和江西、福建等地的灾民迁徙到东北四省。大明朝廷虽然下令各地府县要阻止灾民流窜，但毛钰集团名声在外，而河南等地府县长官大部分频繁更换，不是前任被明敏俊击杀，就是贱到资额并势大而逃亡，朝廷的政令自然没人听。最让朝廷官员担心的不是毛钰而是李自成，因为朱由检坚持东巡，导致被围宁远城，随后朝廷下令各地兵马勤王。镇守陕西的孙传庭也在传召之列。不过等他带着兵马抵达山海关的时候毛钰已经将黄台吉收拾得七七八八。朱由检考虑到祖大寿和毛钰的巨大威胁，加上洪承畴已经被他去职，于是杨嗣昌就出了个主意让孙传庭留在直隶总督京畿兵马。
这下京城倒是安全了，但李自成也乔准了机会，于是再次联合陕西、甘肃等地的农民军，迅速席卷各地。这一次李自成吸取了教训，高迎祥破凤阳那次是被毛钰坏了事，自己率兵入南京也是被毛钰打出来。他知道真刀真枪的干仗他的手下肯定不是毛钰的对手，所以他一方面派人打听毛钰的动静，一方面拼命壮大自己的实力，然后继续盘踞河南、陕西一带并不急于往东南去。
当他得知毛钰在结束辽东战事将大部分兵马留在东北之后也是松了一口气，显然毛钰和大明朝廷一样并没有将他作为心腹大患。当然李自成也并没有就此直捣南京或杭州。他知道毛钰通过海上运输的速度之快比陆地上快许多。或许他没抵达开封毛钰就会收到消息，所以他就跟手下人定下了北上的计划，因为毛钰再厉害也只是一方诸侯，大明皇帝在北方，想坐天下自然要将京城那个皇帝拉下马。