公元1401年，在日本南北朝结束之后，室町幕府第三代将军足利义满派家臣祖阿为正使，向明朝正式递交国书，大明永乐帝册封日本幕府将军足利义满为日本国王。1404年，日本派遣明室楚亮出使开始勘合贸易(明日贸易)；这使得日本遣明使的制度得到了确定。
从1401年室町幕府的祖阿到1549年大内氏的策彦周良，日本一直向明朝派遣遣明使：一方面是与中国的贸易，另一方面是向中国学习，同时也是向日本国内其他政治势力示威，以作为自己合法性的方式之一；总计148年，19任。以室町幕府名义上统一日本为开始，以大内氏在日本内部政治斗争中的失败为结束。
而现在，朱由校十分的渴望增加对日本的影响力，而朝鲜就是欧亚大陆对日本列岛的跳板。
说回正题，朝鲜早在30年前就已经向大明上述要求内附了，而当时的明政府也表示支持。
壬辰战争结束后，万历皇帝的《平倭诏》中有“属者东夷小丑平秀吉，猥以下隶，敢发难端，窃据裔封，投属诸岛，遂兴荐食之志，窥我内附之邦”，将朝鲜视为内附之邦；明兵部职方司郎中贾维伦作平倭铭，刻于釜山，铭文中也有“盖惟朝鲜，内附称藩，与国同久”之句。
但是直到朱由校派锦衣卫协助进行颠覆任务，并且派出士兵驻扎之前，朝鲜仍然是一个相对独立的状态。
1592年六月十三日，朝鲜国王李昖向大臣表示自己要渡江内附。原因很简单：在日军的快速推进下朝鲜过半的国土已经沦陷，“我国地方，则无可避之处”；而“安南国尝亡其国，自为入朝，天朝发兵送之，安南得以复国”，他认为明朝曾帮助安南复国，自然也有可能助朝鲜复国。
但是这个计划，受到了多数大臣反对，只不过在形式的逼迫下，这种反对是没有效果的。
不过明朝此时对朝鲜朝鲜是不信任的：一是朝鲜败得实在太快，以至于很多人怀疑；同时琉球、与明朝在日“商人”奏报的日本情报中均提及了日本与朝鲜勾结，企图攻打大明的假情报（历史证明，朝鲜不是打假赛，而是真的菜）。第二，在朝鲜上奏日本情报问题上，朝鲜避实就虚隐瞒了自己曾经派遣使团出访日本的情节（在古代藩属国没有自主外交权，藩属私自出使外国是违反礼制的）。
不过最终，在大明了解情况之后，万厉帝以下旨的形式，同意了“内附”的请求。（朝鲜请益援兵，须确议具奏。王来，择善地居之。——《明神宗实录》
朝鲜国王在决议内附后，即刻进行种种准备工作，而明朝也有条件地同意了国王的请求，但国王却突然中止内附计划，转而提议“南归”，原因在于形势已经发生变化。
大明军队入朝遏制了日军的进攻，并且光复了大片失地，朝鲜局势愈趋好转。朝鲜国内的臣剧烈反对国王内附，甚至公然要求国王内禅。如此重重，最终都导致了内附计划的破产。